Biyoinformatik

From Wikiversity

Biyoinformatik ve bilgisayarlı biyoloji, genellikle moleküler düzeyde biyolojik sorunları çözmek için uygulamalı matematik, bilişim, istatistik, bilgisayar bilimi, yapay zeka, kimya ve biyokimya gibi tekniklerin kullanılmasını içerir. Bilgisayarlı biyoloji araştırmaları çoğu zaman sistem biyolojisi ile örtüşmektedir. Alandaki ana araştırma çabaları; dizi hizalaması, gen bulma, genom birleştirme, protein yapı hizalaması, protein yapı tahmini, gen ekspresyonu tahmini, protein-protein etkileşimleri ve evrimin modellenmesini içerir.

Biyoinformatik ve bilgisayarlı biyoloji terimleri genellikle birbirlerinin yerine kullanılır. Bununla birlikte, biyoinformatik daha doğru bir şekilde, biyolojik verilerin yönetimi ve analizinden ortaya çıkan veya bunlardan esinlenen sonucu ve pratik sorunları çözmek için algoritmaların, hesaplamaların ve istatistiksel tekniklerin ve teorinin oluşturulması ve ilerletilmesi anlamına gelir. Diğer taraftan, bilgisayarlı biyoloji, bilgisayarları kullanarak deneysel ve simüle edilmiş verilerle gerçekleştirilen belirli bir biyolojik problemin hipotez odaklı araştırılması anlamına gelir.Bilgisayarlı biyolojinin birincil amacı biyolojik bilginin keşifi ve geliştirilmesidir. Ulusal Sağlık Enstitüleri tarafından, Biyoinformatik ve bilgisayarlı biyoloji çalışma tanımlarında da benzer bir ayrım yapılmıştır. Bilgisayarlı biyoloji, daha az bilinen ancak bilgisayarlı biyokimya ve bilgisayarlı biyofizik gibi eşit derecede önemli alt disiplinleri içerir.

Biyoinformatik ve bilgisayarlı biyoloji projelerindeki ortak bir konu, genom dizilimi gibi yüksek verimli biyolojik teknikler tarafından üretilen verilerden faydalı bilgiler elde etmek için matematiksel araçların kullanılmasıdır. Biyoinformatikteki temsili bir problem, parçalanmış "shotgun" DNA diziliminden yüksek kaliteli genom dizilerinin birleştirilmesidir. Diğer yaygın problemler, mikrodizilerden veya kütle spektrometrisinden elde edilen verileri kullanarak gen regülasyonu çalışmasını içerir.

Önkoşullar[edit]

Biyoinformatiği anlamak için temel bilgisayar kullanımını ve moleküler biyolojiyi bilmek gerekir. İleri seviye çalışmalar için biraz Matematik, Bilgisayar Yönetimi ve Bilgisayar Programlama bilmek gerekebilir.

Öğrenme materiyaller ve projeleri[edit]

Dizi hizalama egzersizleri[edit]

Kaynakça[edit]

Bilimsel dergiler[edit]

Linkteki dergiler: Directory of Open Access Journals

Erişime açık internet üzerinden biyoinformatik kursları[edit]

Erişime açık dergiler[edit]

Hibrid erişim dergileri[edit]